微生物肥料是由一种或数种有益微生物、经工业化培养发酵而成的生物性肥料，应用于农用生产，通过其中所含微生物的生命活动，增加植物养分的供应量或促进植物生长，提高产量，改善农产品品质及农业生态环境。特别是保护地蔬菜生产中，针对连年超量施肥，土壤中残余大量未被吸收成分，对土质造成破坏引起的土壤盐化、酸化，通过施用微生物肥料，可明显起到改良土壤、减少化肥用量、提高蔬菜品质的作用。

复合微生物肥料：是把无机营养元素、有机质、微生物菌有机结合于一体，体现无机化学肥料、有机肥料以及微生物肥料的综合效果，是化解土壤板结现象，修复和调理土壤，提高化学肥料利用率，提高果实品质及产量的首推肥料。

生物有机肥：是指特定功能微生物与主要以动植物残体为来源并经无害化处理、腐熟的有机物料复合而成的肥料。

微生物肥料具有生态适应性，施用时应依据当地生态状况、作物品种、土壤类型和耕作方式等确定具体施用方式和施用量，以达到较佳的作用效果。

微生物肥料可用作基肥、追肥、沟施或穴施，还可拌种、浸种、蘸根。其中生物有机肥一般作基肥、种肥、追肥。农用微生物菌剂除作基肥、种肥、追肥外，还可叶面喷施等。

1、微生物肥料对土壤条件要求比较严格。一般微生物肥料中的微生物在土壤温度为18℃-25℃时生命活动较为活跃，15℃以下时活性开始降低，10℃以下时活动能力已很微弱，甚至处于休眠状态。因此，微生物肥料使用注意土壤温度，土壤湿度。

2、注意施肥时期。微生物肥料施入土壤后，微生物需要一个适应、生长、供养、繁殖的过程，一般在15天后可发挥作用。如果作追施，在作物的营养临界期前施用。施用时间适宜在清晨和傍晚或无雨阴天，这样可避免阳光中的紫外线将微生物杀死。避免在高温、干旱条件下使用。

3、微生物肥料不能长期泡在水中，在水田施用应干湿灌溉，促进微生物活动。以好氧型微生物为主的产品，则尽量不要用在水田。

4、微生物菌剂在施足有机肥基础上效果佳。如果土壤中的有机质供应充足，菌剂中微生物就会大量繁殖，抑制有害菌。反之，微生物就会因食物缺乏而死亡。因此，作物定植前一定要施足有机肥。

5、微生物肥料可单独使用，也可与其它肥料混合使用。但微生物肥料应避免与未腐熟的农家肥混用，否则会因农家肥发酵产生的高温杀死微生物而影响肥效。此外，避免与过酸、过碱的肥料混用。

6、避免与农药同时使用。化学农药都会不同程度抑制微生物的生长和繁殖，甚至杀死微生物。不要将微生物肥料与杀菌剂、杀虫剂、除草剂和含硫的化肥(如硫酸钾等)以及草木灰混合用。不用拌过杀虫剂、杀菌剂的工具装微生物肥料。

7、微生物肥料不宜久放。拆包后要及时施用，注意产品保质期。